Auf dem blauen Gemeindewappen von Arnesano stehen drei Hügel; auf dem Mittleren brennt eine Flamme. Auf dem Gebiet sind zahlreiche archäologische Auffindungen gemacht worden, die den  gewissen, uralten Ursprung der Ortschaft bezeugen. Es handelt sich um handgefertigte Gegenstände aus Bronze und Stein, antike Münzen und einige primitive Vasen, die in einem Grab (Jungsteinzeitalter) entdeckt worden sind. All diese Gegenstände sind während den Ausgrabungen im Gebiet aufgefunden worden, und zur Zeit im Museum „Sigismondo Castromediano“ zu Lecce aufbewahrt. Die Hypothesen in Bezug auf die Ortschaftsgründung sind sehr widerstritten. Es besteht die Meinung, dass die Ortschaft von griechischen Kolonisten gegründet worden sei, die die Viehzucht ausübten. In diesem Fall brachte man den Ortsname mit dem griechischen Wort „arnes“ (griech.=Lamm)  in Zusammenhang. Laut einer anderen Hypothese soll die Ortschaft vom römischen Zenturio Arnisius gegründet worden sein. Er hätte dieses Land als Belohnung, für den im Krieg bewiesenen Mut erhalten. Er liess seine Residenz und die Häuser seiner Soldaten erbauen und im Laufe der Zeit vergrösserte sich das Örtchen immer mehr. Die dritte Vermutung besteht aus der Ableitung des lateinischen Ausdrucks „aer sanus“, der sich auf das gute Klima des Gebietes bezog. In der Tat gingen viele Leute zum Gehöft Arnesano um gesunde Luft zu  atmen, die den Leuten mit  Atembeschwerden gut tat. Mit der Normannenherrschung fing das Feudalzeitalter an, als der König Tancredi D’Altavilla das Lehen in die Grafschaft Lecce eingliederte. Später wurde es Besitz der Familie Caracciolo (bis Mitte 14.Jh.). Im 15.Jh. wurde Antonio Guidano vom König Ferdinand I. mit dem Land belehnt. Im Jahre 1489 wurde es von der Familie Corso erworben, die es mehr als ein Jahrhundert besass. Im 17.Jh. ging es den Marescallo  und infolge den Prato. Die Bernardini waren die letzten Feudalherren, die bis 1806 regierten, Jahr der Aufhebung des Feudalwesens. In Arnesano kamen mehrere berühmte Persönlichkeiten zur Welt. Eine besondere Erwähnung verdient Emanuele Passaby (18.Jh.). Dank der finanziellen Unterstützung des adeligen Lehnsherrn Francesco Prato studierte er in Neapel und wurde ein berühmter Kunstmaler. Er lebte für lange Zeit in Spanien, wo er einen riesigen Erfolg mit seinen Werken erzielte. Raffaele Manca lebte um die Wende des 17. und 18.Jh. und wurde ein Jesuitenpater. Er setzte sich mit Eifer in der Hilfe für die Armen  und Bedürftigen ein, und lehnte jede Situation ab, die auf irgend eine Weise seinen schweren Alltag, voller Leid und Entbehrungen, hätte erleichtern können. Er schrieb zu jener Zeit viele religiöse Werke, doch nur wenige wurden veröffentlicht.