Das blaugrundiere Gemeindewappen von Porto Cesario stellt eine Sirene dar, die ihren Schwanz hält. Auf dem oberen Teil des Wappens steht die Schrift „cesarea comunitas“. Die Ortschaft befindet sich auf der ionischen Küste und ihr Ursprung ist sehr alt. Das  Gebiet ist seit dem Jungsteinzeitalter bewohnt, wie archäologische Auffindungen bezeugen. Auf Grund des Nachrichtenmangels in Bezug auf den Ortschaftsursprung, sind einige Hypothesen aufgestellt worden. Laut einer Meinung soll das erste Dorf  infolge des Baus des Handelshafens, „portus sassinae“, entstanden sein. Später wurde es eine blühende Messapensiedlung, die von den „Gallipolini“ (Einwohner Gallipolis) vernichtet und dem Erdboden gleichgemacht wurde. Die „Gallipolini“ waren nicht bereit den blühenden Handel um den Hafen weiter zu ertragen. Die Ortschaft wiedererstand dank einer Fischergruppe, die sich in diesem Gebiet dauerhaft niederliess. Die ersten geschichtlichen Urkunden sind 13.Jh. datiert und berichten, dass damals Porto Cesareo unbewohnt war. Während der Anjou-Herrschung wurde ein beträchtlicher Kriegs- und Handelshafen verwirklicht. Karl V. liess einen mächtigen Verteidigungsturm erbauen. Auf Grund seiner strategischen Lage war Porto Cesareo für lange Zeit direkter Besitz des Fürstentums Tarent. Wahrscheinlich folgte es ab dem 15.Jh. den Feudalgeschehnissen des nahen Gehöfts Nardò. Auch die kleine Porto Cesareo hat im Laufe der Zeit gewaltige Feindesangriffe erlitten und gross war die Mühe des  Wiederbeginns. Früher war Porto Cesareo Nardos Ortsteil, doch 1974  erhielt er die Selbstverwaltung.